西暦3000年。不法な時間移動を取締まる時間保護局では、レンジャー隊の入隊式が行われていた。同じ頃、凶悪犯罪者が“圧縮冷凍”されて収監されているロンダー刑務所で、悪名高きマフィアのボス・ドルネロが脱獄し、ジャックした刑務所の最上階ごと西暦2000年に消えたという。

海辺の小屋で、ユウリ達から事情を聞くタツヤだが、なにか釈然としない。「30世紀の未来があるってことは、俺の将来も決まっているってこと!?」決まった未来を守るために戦うなんて御免だ、と立ち去る。しかし、帰宅した竜也を待っていた会社社長の父・渡は、自分の会社に入れと命令する。

竜也が独立の為に用意していた部屋で共同生活を始めた5人。竜也は、家賃を払うためにもそれぞれの特技を活かした仕事をしようと提案した。だが、竜也に得意なことなどを聞かれたアヤセは「余計な干渉やめろ」と部屋から出て行ってしまった。

誘拐事件のニュースが入って来た。子供達は保護されたが、犯人の男は身代金を持って行方をくらませているという。手口が気になったユウリは調査に向かう。そこへ電話がなった。何と、それはシオンを誘拐したという脅迫電話だった!

ロンダーズの囚人、殺し屋マッドブラストが街で暴れている。ブラストの胸にぶら下がるブレスレットを見て驚愕するピンク。それはドルネロファミリーを追う捜査官だったユウリの父の物だった。ユウリの家族は彼女が10歳の時に何者かに殺され、ユウリだけが生き残り、犯人は分からずじまいだったのだ。

世界的に有名なダイヤモンド、“ムーンキング”が盗まれた!宝石店店長になりすました犯人の首筋には鳥型のアザがあることから、犯人はロンダーズの連続窃盗犯ルージェであることが分かった。ルージェはいつも女性に変装して獲物に近づき、その首筋には鳥型のアザが出るのだ。

「遅刻だー!試合だ試合!!」と夜中にドモンがトゥモローリサーチを飛び出して行った。竜也が追いかけると、突然ドモンは道端で気を失い、病院に運ばれてしまう。翌日検査をすることになり、竜也はドモンに付き添い病院に泊まる。タックによるとドモンは“データ酔い”だという。

タイムレンジャーが、ロンダーズの囚人・ナボコフに連れ去られそうになっていた青年を助けた。青年の名は鳥羽賢治。まったく売れない貧乏画家だという。だが、彼は今は売れない画家でも、30世紀では“21世紀の巨匠”と称される画家であった。鳥羽はユウリを描きたいと言い出した。

ギエンが解凍した元警察官の囚人、アーノルドKはドルネロの昔馴染みだった。しかし、アーノルドはギエンとリラには尊大な態度をとる。ドルネロに「持つべきものは古い友達だぜ?欲で繋がってる奴はすぐ裏切る」とまで。アーノルドをこのままのさばらしてはおけないと危惧するギエンとリラ。

胸を押さえて苦痛に顔を歪めるアヤセ。竜也だけが異変に気付いて心配するが、アヤセは何でもないと否定する。アヤセは何か隠しているのではと疑う竜也…。そんな時、タックが強い時空パルスをキャッチした。ロンダーズかも知れないと竜也とアヤセが現地へ偵察に向かう。

あるニュータウンで原因不明の傷害事件が起き、多数の負傷者が出た。ニュースを聞いた竜也達はロンダーズのゴウガンの仕業と踏む。元化学者のゴウガンは、催眠誘導装置を使ってある町の住民に殺し合いをさせ、その80%を死なせる事件を30世紀で起こしている。竜也達は町へ急ぐ。

「宇宙人を捜してください」　そんな少年の依頼を受けたシオンは、ある男のところに連れて行かれる。「宇宙人に教えて貰った」と言ってコインを手から手へと転送して見せるその男は、子供達に嘘つき呼ばわりされていた。少年・隼人はその男のために宇宙人がいることを証明したいのだ。

二人のファイターが闘い、客達がその勝敗に賭ける闇カジノ。それにはまった夫を連れ戻してくれ、という妻からの依頼を受け、竜也はファイターとしてバトルカジノへ潜り込む。ところが、対戦相手として登場したのはなんと依頼主の夫・細木!?

宝石泥棒を繰り返しているリラ。凄腕のドライバーの車で追走するパトカーも振り切られてしまう。ドライバーの名はバロン。かつてアヤセと共に30世紀でレーサーを目指していた男だった。だが、バロンは事故を起こして相手に重症を負わせてしまい、居合わせたアヤセが裁判でスピード違反を証言して、圧縮冷凍されていた。

ロンダ―ズが送り込んできた二人目の暗殺者、女スナイパー・レイホウ。そのレイホウにカメラマンのホナミがさらわれてしまった。首に時限爆弾をセットされ広場に座らされているホナミ。レイホウはホナミでタイムレンジャーをおびき寄せ、離れた場所から狙撃するつもりなのだ。

ドモンのせいで依頼客に逃げられてしまった竜也達は、「埋め合わせの仕事を取って来い」とドモンを事務所から閉め出した。　そんな時にドモンが知り合った蕎麦屋『喜八』の店主・菅原。『喜八』の蕎麦はひどく不味く、店は閑古鳥が鳴いていた。自信と気力をなくした菅原を励ますドモン。

竜也の空手教室に入門してきた少年・誠。だが、その動機は金を脅し取る学校の不良グループへの復讐だった。そんなことは知らない竜也は、練習熱心な誠にマンツーマンで空手を教え込んでしまう。やがて誠の様子がおかしいことに気付いた竜也が誠の通う中学を訪ねると、誠は不良グループに脅されていた。

アヤセの発作を再び目撃した竜也。ユウリ達にも話そうというが、アヤセは取り合わない。そんな時、ある研究所までの運転代行の依頼がきた。だが、アヤセが依頼主の所員を乗せて到着した直後、研究所がロンダーズに占拠されてしまった。地下駐車場にいたアヤセは、竜也達に連絡し、研究所内部に潜入する。

ギエンは、手に入れたλ2000を元に30世紀のエネルギー・Z(ゼータ)－3を作り出し、何かを企んでいる。そして、ロンダーズに襲われた浅見グループの研究所でもあるプロジェクトが密かに進行していた。さらに30世紀の未来でも…。一方、竜也達は街でもう一人の自分と出会う。

タイムシャドウ、自分達の幻、そして今までにないギエンの破壊行動など竜也達の手が届かぬ所で何かが動き出している。もしかすると歴史が変化しているのかもしれない、と推測するタック。だが、30世紀に帰れるからこれまでやってきたのに何で歴史が変化するんだ、と動揺し苛立つドモン。