横山光輝の人気コミックを原作にした3度目のアニメ化。西暦2002年。海底火山が噴火して平成新島が誕生。そこで岩倉記者は、少年マーズを発見する。実は、地球を爆破しなければならないという使命をミルキーウェイの神々からマーズは託されていたのだった。人々の優しさに触れ、自らの使命にマーズは疑問を抱くが…。