ダンナーベースに所属するスーパーロボ「ゴーダンナー」のパイロットである猿渡ゴオは、未知の巨大生物「擬態獣」との最終決戦で、パートナーであり恋人であったミラを失ってしまう。その時、それと引き換えるかのように命を救われたのは、まだ12歳の葵杏奈だった。5年後、パイロットを目指す杏奈は、厳しい訓練を受け、ずば抜けたテクニックを身につけ立派に成長していた。そして、杏奈とゴオは再会を果たし、恋人同士に・・・。ミラとの過去を吹っ切り、杏奈との結婚を決意したゴオ。二人はダンナーベースのクルーにも学校にも内緒で、ひっそりと身内だけの結婚式を挙げることにする。しかしその当日、擬態獣出現の緊急連絡が・・・。式を投げ出し、ダンナーベースに走るゴオ。一人残され、あっけにとられるウェディングドレスの杏奈だったが、彼女はただ夫の帰りを待っているような女の子ではなかった!果たして、二人は無事結婚する事ができるのか!??そして、地球の運命は!?